Вероятная причина инцидента - катер мог потерять управление.

"ТЭК КУБАНИ--НОВОСТИ", 07-09-2016. КРАСНОДАР.--- В Азовском море, где во вторник опрокинулся пограничный катер, продолжаются поиски пропавшего пограничника, сообщает "Интерфакс".
"ЧП произошло во вторник недалеко от Должанской косы в Краснодарском крае на Азовском море. Пограничный катер потерял управление и, по предварительным данным, опрокинулся. В результате случившегося трое военнослужащих оказались в воде, двое из них были спасены, ведется поиск третьего пограничника", - сказал собеседник агентства.
По его словам, причины происшествия устанавливаются. "По предварительным данным, катер мог потерять управление", - сказал он.